RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	CH25H	O95992	272 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	TRBC1	P01850	177 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CHRNG	P07510	517 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PIRT	P0C851	137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC166	P0CW27	439 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CD38	P28907	300 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PRDX6	P30041	224 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CCR2	P41597	374 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	AMT	P48728	403 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ENTPD1	P49961	510 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CDKN2D	P55273	166 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	RHOA	P61586	193 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	XIAP	P98170	497 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	FOXM1	Q08050	763 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CDH18	Q13634	790 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	TWIST1	Q15672	202 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF77	Q15935	545 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	SNCB	Q16143	134 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	SNAPC1	Q16533	368 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CDKN3	Q16667	212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	KLC3	Q6P597	504 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	LINGO4	Q6UY18	593 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262		Q75L30	129 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ISCA2	Q86U28	154 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	MFN1	Q8IWA4	741 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	LEMD2	Q8NC56	503 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	MAPK15	Q8TD08	544 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	BAD	Q92934	168 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CNDP1	Q96KN2	507 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	LYSMD1	Q96S90	227 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	NDN	Q99608	321 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	COG4	Q9H9E3	785 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	IL17C	Q9P0M4	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	LRP4	O75096	1905 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC01553	A4QN01	128 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262		A8MUI8	341 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	HIDE1	A8MVS5	230 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CHUK	O15111	745 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC22A2	O15244	555 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	HDAC3	O15379	428 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CCL16	O15467	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	ZBTB14	O43829	449 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	MAGEC1	O60732	1142 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	WISP2	O76076	250 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PRAMEF12	O95522	483 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	IGSF6	O95976	241 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PRSS56	P0CW18	603 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	PSG1	P11464	419 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	SRC	P12931	536 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	GJA1	P17302	382 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	IMPDH1	P20839	514 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	KCNA5	P22460	613 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CD70	P32970	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CTNNB1	P35222	781 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	HMGCL	P35914	325 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	CCR10	P46092	362 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ZNF638-223	ENST00000492262	TTPA	P49638	278 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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