RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 POLLQ9UGP5 575 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASB1Q9Y576 335 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF879B4DU55 563 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFXAPO00287 272 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6orf47O95873 294 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MT-ND4P03905 459 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSD3B1P14060 373 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNR1P21554 472 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPN6P29350 595 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCR7P32248 378 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB2AP61019 212 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC6A3Q01959 620 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCAF15Q66K64 600 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM122BQ7Z309 247 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMIEQ8NEW7 156 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATG101Q9BSB4 218 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 INPP5KQ9BT40 448 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TREX1Q9NSU2 369 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RASL12Q9NYN1 266 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GALPQ9UBC7 116 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABCA3Q99758 1704 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 I6L893 689 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA0355O15063 1070 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 F2P00734 622 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD3GP09693 182 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGAP20933 346 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOS3P29474 1203 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DDTP30046 118 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNR2P34972 360 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDKN2CP42773 168 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MVDP53602 400 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLA2G7Q13093 441 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT33BQ14525 404 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MOB3CQ70IA8 216 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CPXCR1Q8N123 301 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 POC1BQ8TC44 478 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF139Q8WU17 664 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NTAN1Q96AB6 310 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEX12Q9BXU0 123 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCO2Q9BYV7 579 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FZD3Q9NPG1 666 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LHX9Q9NQ69 397 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLN6Q9NWW5 311 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR81Q562E7 1941 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR6C76A6NM76 312 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFITM10A6NMD0 228 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCLK1O15075 740 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MID1O15344 667 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUV39H1O43463 412 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CILPO75339 1184 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOD1P00441 154 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HIST1H2ABP04908 130 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C6P13671 934 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LCP1P13796 627 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACHEP22303 614 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SHC1P29353 583 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SDHAP31040 664 aa6.51□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AKT1P31749 480 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms