RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 RNF111Q6ZNA4 994 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC29A4Q7RTT9 530 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 VASH2Q86V25 355 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC30A8Q8IWU4 369 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ZNF615Q8N8J6 731 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ADCY4Q8NFM4 1077 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 OR11G2Q8NGC1 345 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ZNF721Q8TF20 911 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 KAT2AQ92830 837 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TP53INP1Q96A56 240 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 RNF31Q96EP0 1072 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 IMMP1LQ96LU5 166 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 STACQ99469 402 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ECSITQ9BQ95 431 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CNPPD1Q9BV87 410 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ACTRT3Q9BYD9 372 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 OR10A5Q9H207 317 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MMP25Q9NPA2 562 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 DUSP22Q9NRW4 184 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLAMF8Q9P0V8 285 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ERVK-11Q9UQG0 969 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ERVK-19Q9WJR5 959 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 FLNCQ14315 2725 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TMEM247A6NEH6 219 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CBX7O95931 251 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ITGB2P05107 769 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 GSNP06396 782 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 GUSBP08236 651 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CT62P0C5K7 136 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 COX6A1P12074 109 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 BMP2P12643 396 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 OTX2P32243 289 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SOX18P35713 384 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 PPICP45877 212 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CPA2P48052 419 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 KHKP50053 298 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 EMDP50402 254 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 RPS18P62269 152 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 GAB1Q13480 694 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 RGNQ15493 299 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 CDC73Q6P1J9 531 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ERICH5Q6P6B1 374 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 HSDL2Q6YN16 418 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MRGPREQ86SM8 312 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SERPINA11Q86U17 422 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MSRB3Q8IXL7 192 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 LGI4Q8N135 537 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 OR52R1Q8NGF1 315 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 NUBPLQ8TB37 319 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ELP5Q8TE02 316 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 PMM1Q92871 262 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 OR8D2Q9GZM6 311 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 LRMDAQ9H2I8 198 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 EXD2Q9NVH0 621 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 GPATCH2Q9NW75 528 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 P4HTMQ9NXG6 502 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TMEM181Q9P2C4 612 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 BCAP29Q9UHQ4 241 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 LIPT1Q9Y234 373 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 RELNP78509 3460 aa10.87□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 FER1L5A0AVI2 2057 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 LRRK2Q5S007 2527 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 A8MUA0 341 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ACOX3O15254 700 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ZFAND5O76080 213 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SERPINA7P05543 415 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 ALOX5P09917 674 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 DRD5P21918 477 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MATN1P21941 496 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 LCN1P31025 176 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 MAP3K8P41279 467 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 PRKAG1P54619 331 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SOX8P57073 446 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A3Q00325 362 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-211ENST00000488243 TLE1Q04724 770 aa10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms