RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC115Q96NT0 180 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 PANX1Q96RD7 426 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM107BQ9H098 131 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 Q9N2J8 555 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 NTMQ9P121 344 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC154A6NI56 674 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 TP53I11O14683 189 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 WNT3P56703 355 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 INAQ16352 499 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA21Q7Z572 469 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC34A3Q8N130 599 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 MDS2Q8NDY4 140 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM13CQ8NE31 585 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 OR9I1Q8NGQ6 314 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 ITCHQ96J02 903 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC167Q9P0B6 97 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 VPS4AQ9UN37 437 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 NR5A2O00482 541 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 RFXANKO14593 260 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 TO15178 435 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SOX30O94993 753 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 ANP32DO95626 131 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SP1P08047 785 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO45P0C2W1 286 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 NAGAP17050 411 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 UQCRC2P22695 453 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCD3P28288 659 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 RCAN2Q14206 197 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 AGKQ53H12 422 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SPINK14Q6IE38 97 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 JADE3Q92613 823 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-212ENST00000472427 SCN2BO60939 215 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCB7O75027 752 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 NEURL1O76050 574 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 P04436 131 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 ALOX5P09917 674 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 IL12BP29460 328 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 SEC24CP53992 1094 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 MFSD12Q6NUT3 480 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC9A6Q92581 669 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 OMA1Q96E52 524 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 SPDL1Q96EA4 605 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 KLHL1Q9NR64 748 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 LUZP4Q9P127 313 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.07■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 TTLL8A6PVC2 850 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 B8ZZF3 427 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 NME2P1O60361 137 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 PPM1BO75688 479 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNH1O95259 989 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 CT45A8P0DMV1 189 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 CT45A9P0DMV2 189 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 NME2P22392 152 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 CORO7P57737 925 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 PHC1P78364 1004 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 NTRK2Q16620 822 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 DECR1Q16698 335 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 CT45A2Q5DJT8 189 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 PRR22Q8IZ63 422 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR151Q8TDV0 419 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 C10orf82Q8WW14 230 aa20.06■□□□□ 0.8
RALGPS1-212ENST00000472427 SCMH1Q96GD3 660 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms