RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 RAB33BQ9H082 229 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HRASLS2Q9NWW9 162 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A12Q9NXJ0 267 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 AASSQ9UDR5 926 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SATB2Q9UPW6 733 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LIPT1Q9Y234 373 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LMO7DNF2Z398 122 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FAM227AF5H4B4 570 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 SIAH2O43255 324 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 B3GALT2O43825 422 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FGF17O60258 216 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 GADD45GO95257 159 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ATE1O95260 518 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GPR75O95800 540 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GASTP01350 101 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MT-ND2P03891 347 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 IL9P15248 144 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP24386 653 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CD38P28907 300 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 HOXA6P31267 233 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PRKAR1BP31321 381 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FMO3P31513 532 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TGFBR2P37173 567 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 PRR5P85299 388 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 ILKQ13418 452 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 DOC2BQ14184 412 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 CTF1Q16619 201 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 C12orf73Q69YU5 71 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf94Q6P1W5 598 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 BHLHB9Q6PI77 547 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD13Q7L211 337 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.28□□□□□ -1.56
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