RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 MASP1P48740 699 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINB9P50453 376 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAS1P54826 345 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 GFRA1P56159 465 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLCQ05315 142 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFT88Q13099 833 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUP54Q7Z3B4 507 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDC20BQ86Y33 519 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 MZB1Q8WU39 189 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 NINJ1Q92982 152 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLHL29Q96CT2 875 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSTM2LQ96N03 204 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 FMO2Q99518 471 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERHLQ9NQF3 203 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLL4Q9NR61 685 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 MANBAO00462 879 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 DVL2O14641 736 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLX3O60479 287 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 DIAPH2O60879 1101 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 OTCP00480 354 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL3P08700 152 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPN1P15169 458 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 DRD5P21918 477 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPICP45877 212 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXA1P55317 472 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLDN18P56856 261 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRG3P56975 720 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CORO7P57737 925 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLCXD2Q0VAA5 305 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 PACS2Q86VP3 889 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1J4Q8NGS1 313 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMBIM1Q969X1 311 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35A4Q96G79 324 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 APIPQ96GX9 242 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 POM121Q96HA1 1249 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 BTBD9Q96Q07 612 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 UCN2Q96RP3 112 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNA7Q96RP8 456 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIB1Q96RU8 372 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF382Q96SR6 550 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACPTQ9BZG2 426 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 AHSPQ9NZD4 102 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCM8Q9UJA3 840 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 EMCNQ9ULC0 261 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.68□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 FRG2CA6NGY1 282 aa7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACOX3O15254 700 aa7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 HCRTR2O43614 444 aa7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL18BPO95998 194 aa7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACTL6AO96019 429 aa7.67□□□□□ -1.18
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL2RAP01589 272 aa7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms