RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448136.5

SNHG16-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNHG16, Length 3,607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PADI3Q9ULW8 664 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 MMP20O60882 483 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SLC2A10O95528 541 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TGFB1P01137 390 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TCRBP04435 133 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 DGKAP23743 735 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 OR51B5Q9H339 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 DLL4Q9NR61 685 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 RASD1Q9Y272 281 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 HCN1O60741 890 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 NR2F6P10588 404 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ALPPL2P10696 532 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CPEP16870 476 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ATP12AP54707 1039 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ERVK-25P63136 954 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 HSF2Q03933 536 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CLLU1Q5K131 121 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 HSDL2Q6YN16 418 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 KLK6Q92876 244 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 RFT1Q96AA3 541 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF416Q9BWM5 594 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CNIH4Q9P003 139 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 F5H5T6 163 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 H3BSH0 61 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GABRPO00591 440 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PDCD5O14737 125 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CELF2O95319 508 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 IFNW1P05000 195 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 EPHX1P07099 455 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CXCL2P19875 107 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 HMGA2P52926 109 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 BLVRAP53004 296 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PPP3R1P63098 170 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 E2F1Q01094 437 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PCDH1Q08174 1060 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ANGPT1Q15389 498 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ETFDHQ16134 617 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PLA1AQ53H76 456 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CST9Q5W186 159 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PAQR7Q86WK9 346 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 APCDD1Q8J025 514 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SUSD3Q96L08 255 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 FCRL1Q96LA6 429 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CA10Q9NS85 328 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 HPF1Q9NWY4 346 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.49□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ARPC5O15511 151 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ADAM12O43184 909 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 DPM1O60762 260 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 STATHP02808 62 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 LIMS3P0CW19 117 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 LIMS4P0CW20 117 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CBR1P16152 277 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CBX5P45973 191 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 WNT4P56705 351 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 ADAM15Q13444 863 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 OPCMLQ14982 345 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TCTE1Q5JU00 501 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 TMEM107Q6UX40 140 aa9.48□□□□□ -0.89
SNHG16-201ENST00000448136 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms