RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 EIPR1Q53HC9 387 aa12.66□□□□□ -0.38
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PRAME-209ENST00000439106 TMEM211Q6ICI0 200 aa12.66□□□□□ -0.38
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PRAME-209ENST00000439106 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa12.66□□□□□ -0.38
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PRAME-209ENST00000439106 HCN1O60741 890 aa12.65□□□□□ -0.38
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PRAME-209ENST00000439106 CT45A8P0DMV1 189 aa12.65□□□□□ -0.38
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PRAME-209ENST00000439106 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
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PRAME-209ENST00000439106 LGALS13Q9UHV8 139 aa12.65□□□□□ -0.38
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PRAME-209ENST00000439106 MAPRE3Q9UPY8 281 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 C15orf41Q9Y2V0 281 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 A0A0G2JNJ9 132 aa12.64□□□□□ -0.39
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PRAME-209ENST00000439106 LINC00032P0C843 101 aa12.64□□□□□ -0.39
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PRAME-209ENST00000439106 CDK9P50750 372 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PRAME-209ENST00000439106 NAA20P61599 178 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-209ENST00000439106 RPP38P78345 283 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PRAME-209ENST00000439106 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PRAME-209ENST00000439106 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-209ENST00000439106 ZNF385BQ569K4 471 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-209ENST00000439106 SH2D4BQ5SQS7 431 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-209ENST00000439106 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PRAME-209ENST00000439106 GDF7Q7Z4P5 450 aa12.64□□□□□ -0.39
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