RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 ADAMTS20P59510 1910 aa8.97□□□□□ -0.97
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C9J4A7 227 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SYT5O00445 386 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TIPRLO75663 272 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MT-CO3P00414 261 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 BCHEP06276 602 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HEXBP07686 556 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ACADSP16219 412 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DRD5P21918 477 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TGM1P22735 817 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IFNA8P32881 189 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PPICP45877 212 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KCNJ5P48544 419 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EMP2P54851 167 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ERV3-1Q14264 604 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LTB4RQ15722 352 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SYT16Q17RD7 645 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ISXQ2M1V0 245 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GPAT3Q53EU6 434 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 STPG1Q5TH74 334 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RAB8BQ92930 207 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MAL2Q969L2 176 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35B4Q969S0 331 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FBXL20Q96IG2 436 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 BTBD9Q96Q07 612 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SDF2Q99470 211 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PINK1Q9BXM7 581 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR10A5Q9H207 317 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 Q9H521 79 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HHATLQ9HCP6 504 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 Q9N2J8 555 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 THSD1Q9NS62 852 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PADI1Q9ULC6 663 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 A8MVJ9 347 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C17orf105B2RV13 164 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ADAMDEC1O15204 470 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 BRINP1O60477 761 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CBX7O95931 251 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RECKO95980 971 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SEMG1P04279 462 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ALPPP05187 535 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 THBS1P07996 1170 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RHCEP18577 417 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PRKAR1BP31321 381 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GABRA3P34903 492 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SOX18P35713 384 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SOX11P35716 441 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EMDP50402 254 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HMGA2P52926 109 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SESN3P58005 492 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KCNJ10P78508 379 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EPS8Q12929 822 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DUSP8Q13202 625 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SYPL1Q16563 259 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 VWA2Q5GFL6 755 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.95□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LILRA2Q8N149 483 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms