RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 PDE9AO76083 593 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 VIPP01282 170 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 ITGA2P17301 1181 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 IGFBP5P24593 272 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 AQP1P29972 269 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 SLAMF1Q13291 335 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 GPR18Q14330 331 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 ELOCQ15369 112 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 REEP3Q6NUK4 255 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 RCBTB1Q8NDN9 531 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 OR8K5Q8NH50 307 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 NCSTNQ92542 709 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 SLC35G5Q96KT7 338 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 AMDHD1Q96NU7 426 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 TAAR9Q96RI9 348 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 A0A0G2JN53 185 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 MYO1GB0I1T2 1018 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 PPM1DO15297 605 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 AIFM1O95831 613 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 CLIC3O95833 236 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 HLCSP50747 726 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 BLKP51451 505 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 CDC20Q12834 499 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 HSPB3Q12988 150 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 FAHD1Q6P587 224 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 RSC1A1Q92681 617 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 TM4SF19Q96DZ7 209 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRC-206ENST00000413409 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 A0A1W2PR48 441 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 WIPF3A6NGB9 483 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 C2orf74A8MZ97 194 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 C5orf58C9J3I9 102 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 B4GAT1O43505 415 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 DNAJB5O75953 348 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 GLB1P16278 677 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 CERS1P27544 350 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 KHKP50053 298 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 CEBPEQ15744 281 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 TEX19Q8NA77 164 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 SETD9Q8NE22 299 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 MUS81Q96NY9 551 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 BBS4Q96RK4 519 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 TSC22D3Q99576 134 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 ING2Q9H160 280 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 NDUFAF4Q9P032 175 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 C5AR2Q9P296 337 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 PHF11Q9UIL8 331 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 CES1P1Q9UKY3 287 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 U3KQV3 271 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 HIVEP1P15822 2718 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 URADA6NGE7 173 aa16■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 A8MVJ9 347 aa16■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 M0QX08 132 aa16■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 RAD1O60671 282 aa16■□□□□ 0.15
PTPRC-206ENST00000413409 B4GALT2O60909 372 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms