RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 F3P13726 295 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CRYBB2P43320 205 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 GINS1Q14691 196 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 GPR19Q15760 415 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 WDFY2Q96P53 400 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ASPNQ9BXN1 380 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PRRG3Q9BZD7 231 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 XKR8Q9H6D3 395 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 NUMA1Q14980 2115 aa22.35■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 HYKKA2RU49 373 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SLC35F4A4IF30 521 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PPM1DO15297 605 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TNNI3P19429 210 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SYT14P1Q58G82 188 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 COMTD1Q86VU5 262 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ASB12Q8WXK4 309 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SLC30A2Q9BRI3 323 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TVP23BQ9NYZ1 205 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 NTMQ9P121 344 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 MYL12BO14950 172 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PGRMC2O15173 223 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PROM1O43490 865 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 AIFM1O95831 613 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 NDUFS1P28331 727 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 IFNA8P32881 189 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 FEN1P39748 380 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF4P43489 277 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 RORCP51449 518 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 BNC1Q01954 994 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 RPE65Q16518 533 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SZRD1Q7Z422 152 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OR8K5Q8NH50 307 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SETD6Q8TBK2 473 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 FBRSQ9HAH7 460 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 KCNK6Q9Y257 313 aa22.34■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 A0A0G2JN53 185 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PP55 124 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 GSAPA4D1B5 854 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PRKYO43930 277 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TPST2O60704 377 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 AGR2O95994 175 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 RAB40BQ12829 278 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TRAM2Q15035 370 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TMEM44Q2T9K0 475 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ZNF681Q96N22 645 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 PRDM8Q9NQV8 689 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 OR6C2Q9NZP2 312 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 CLEC2DQ9UHP7 191 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 SSR3Q9UNL2 185 aa22.33■■□□□ 1.17
PMS1-205ENST00000409985 TMEM129A0AVI4 362 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 STK25O00506 426 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 HBQ1P09105 142 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CPEP16870 476 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN31Q12999 210 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TDGQ13569 410 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 IQCHQ86VS3 1027 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 OR52I1Q8NGK6 324 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 TMEM163Q8TC26 289 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 APOOQ9BUR5 198 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 DUXAA6NLW8 204 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 C4orf51C9J302 202 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PRODHO43272 600 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 IL1AP01583 271 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PRKAR1BP31321 381 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 GPAT3Q53EU6 434 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 WASH2PQ6VEQ5 465 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 PHC2Q8IXK0 858 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ELP4Q96EB1 424 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 CEP19Q96LK0 163 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 OR7D2Q96RA2 312 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SLC38A1Q9H2H9 487 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 SMURF1Q9HCE7 757 aa22.32■■□□□ 1.16
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms