RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 TM9SF2Q99805 663 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 WFDC6Q9BQY6 131 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 BDH2Q9BUT1 245 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 MMP27Q9H306 513 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 EQTNQ9NQ60 294 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 AHSPQ9NZD4 102 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 RHCGQ9UBD6 479 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 PRAMEF25A6NGN4 478 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 UMPSP11172 480 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 CBLP22681 906 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 TTC23Q5W5X9 447 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 FCRL6Q6DN72 434 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 LGALS12Q96DT0 336 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 RNF170Q96K19 258 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 MUC13Q9H3R2 512 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 RAB23Q9ULC3 237 aa16.85■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0A6YYD5 115 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 TRBC2A0A5B9 178 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 G3V2T6 193 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 IL7P13232 177 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ICAM2P13598 275 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 PSMB9P28065 219 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ALDH3A2P51648 485 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 SPPL2AQ8TCT8 520 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 PHOX2BQ99453 314 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 FAM60AQ9NP50 221 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 B3GALNT1O75752 331 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 AIFM1O95831 613 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 EPHA2P29317 976 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 TGFBR1P36897 503 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 RABIFP47224 123 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF425Q6IV72 752 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 CEACAM20Q6UY09 585 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 CAMKMTQ7Z624 323 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 DEFB123Q8N688 67 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 KAT2AQ92830 837 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF639Q9UID6 485 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.84■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF9O43307 516 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 SEMA3DO95025 777 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 PSKH1P11801 424 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 DAG1Q14118 895 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 CPZQ66K79 652 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 TOR3AQ9H497 397 aa16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
PDE4D-204ENST00000358923 HS6ST1O60243 411 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 C21orf58P58505 322 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF45Q02386 682 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 HHEXQ03014 270 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 SPATS1Q496A3 300 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 PAQR7Q86WK9 346 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 LMX1AQ8TE12 382 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 YIPF6Q96EC8 236 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 NUAK2Q9H093 628 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 FSCN3Q9NQT6 498 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 FAM227AF5H4B4 570 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 SLC1A7O00341 560 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 TNFRSF21O75509 655 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 CLEC3AO75596 197 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 SLITRK5O94991 958 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 CCNDBP1O95273 360 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 BCHEP06276 602 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 RETP07949 1114 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 GPC1P35052 558 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC74AQ0VAA2 488 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 SCARB2Q14108 478 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PDE4D-204ENST00000358923 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms