RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SPEF1Q9Y4P9 236 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA1O95477 2261 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GTH9 108 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 A8MT66 165 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 VGLL3A8MV65 326 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 H7C0S8 307 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GFYI3L273 518 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TYROBPO43914 113 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CTSVO60911 334 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C1QAP02745 245 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CD79AP11912 226 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DRD2P14416 443 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GSTM2P28161 218 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MSX1P28360 303 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GPR143P51810 404 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CDH15P55291 814 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP2Q05923 314 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DCST1Q5T197 706 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LYPD8Q6UX82 237 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GLRX5Q86SX6 157 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SNX32Q86XE0 403 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SPNS2Q8IVW8 549 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR9A2Q8NGT5 310 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CKAP2Q8WWK9 683 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TMBIM1Q969X1 311 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC41A2Q96JW4 573 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EPN3Q9H201 632 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR10A5Q9H207 317 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR51B6Q9H340 312 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 QPCTLQ9NXS2 382 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MIA3Q5JRA6 1907 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 H3BN98 237 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PIP5K1BO14986 540 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PLIN3O60664 434 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ENTPD5O75356 428 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 AGR2O95994 175 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-9P01782 118 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NPPBP16860 134 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRPS1L1P21108 318 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CRISP3P54108 245 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EPS8Q12929 822 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CBLBQ13191 982 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CTSL3PQ5NE16 218 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C18orf63Q68DL7 685 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A19Q695T7 634 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TRILQ7L0X0 811 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HPS6Q86YV9 775 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MZB1Q8WU39 189 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP10Q96AY3 582 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CCT8L2Q96SF2 557 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NRTNQ99748 197 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ASPNQ9BXN1 380 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CDH20Q9HBT6 801 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KRT84Q9NSB2 600 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 THAP1Q9NVV9 213 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP13Q9UII6 198 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MCM8Q9UJA3 840 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MKLN1Q9UL63 735 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PPIL1Q9Y3C6 166 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ATP23Q9Y6H3 246 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PP18 115 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf98E9PRG8 122 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EBAG9O00559 213 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PCDH17O14917 1159 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CASC3O15234 703 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EMC8O43402 210 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TPST2O60704 377 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A3O75751 556 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PDYNP01213 254 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ITGB2P05107 769 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HEXAP06865 529 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CD1DP15813 335 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 IMPDH1P20839 514 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PTNP21246 168 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MATN1P21941 496 aa4.14□□□□□ -1.75
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