RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PDP2Q9P2J9 529 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 A8MVJ9 347 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 J3KTA2 159 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ALOX5P09917 674 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SP9P0CG40 484 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GCGRP47871 477 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PDX1P52945 283 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KCNAB2Q13303 367 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 LPAL2Q16609 132 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TTC23Q5W5X9 447 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FAHD1Q6P587 224 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DEF8Q6ZN54 512 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 HMGN2P46Q86SG4 172 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 COX18Q8N8Q8 333 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DGAT2Q96PD7 388 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 STACQ99469 402 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PIGUQ9H490 435 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FGF21Q9NSA1 209 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 A0A1W2PQM1 296 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DSCR3O14972 297 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CBX7O95931 251 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SMIM18P0DKX4 95 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MAOAP21397 527 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ALAS2P22557 587 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PIGAP37287 484 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR1D4P47884 311 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 BTG2P78543 158 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CCL7P80098 99 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DAB2P98082 770 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CHRNEQ04844 493 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MAP4K2Q12851 820 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DSG2Q14126 1118 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ERV3-1Q14264 604 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FRRS1Q6ZNA5 592 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 COMTD1Q86VU5 262 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR52J3Q8NH60 311 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GIPC3Q8TF64 312 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RIT1Q92963 219 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR1F2PQ96R84 312 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PINK1Q9BXM7 581 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 LRRN3Q9H3W5 708 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KRT84Q9NSB2 600 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FAM118AQ9NWS6 357 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KCND3Q9UK17 655 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SATB2Q9UPW6 733 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 WDR45Q9Y484 360 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SEC16AO15027 2179 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 A0A1B0GX78 115 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 M0R3H8 397 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SYT5O00445 386 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 JRKO75564 520 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GADD45GO95257 159 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 AK1P00568 194 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ITGAMP11215 1152 aa9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 STT3AP46977 705 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms