RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297661.8

UBAP1-201, Transcript of ubiquitin associated protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBAP1, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1-201ENST00000297661 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.71□□□□□ -0.05
UBAP1-201ENST00000297661 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.71□□□□□ -0.05
UBAP1-201ENST00000297661 SCML1Q9UN30 329 aa14.71□□□□□ -0.05
UBAP1-201ENST00000297661 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.71□□□□□ -0.05
UBAP1-201ENST00000297661 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GPR37L1O60883 481 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RECKO95980 971 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SOD1P00441 154 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CAV3P56539 151 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 IKZF1Q13422 519 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FCN2Q15485 313 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 DPPA4Q7L190 304 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 C12orf40Q86WS4 652 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GPR65Q8IYL9 337 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PIGUQ9H490 435 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.71□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 NOTCH4Q99466 2003 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 A0A0G2JN53 185 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 A0A1W2PPC1 479 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZAR1LA6NP61 321 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ISM1B1AKI9 464 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MMP20O60882 483 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 STATHP02808 62 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TPOP07202 933 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GRK1Q15835 563 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GHDCQ8N2G8 530 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 UCN3Q969E3 161 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 NELL2Q99435 816 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PIP5K1AQ99755 562 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PLXNA2O75051 1894 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 LINC01565O15544 149 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CHP2O43745 196 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 BCHEP06276 602 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RIN1Q13671 783 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 IL18Q14116 193 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FGFBP1Q14512 234 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SZRD1Q7Z422 152 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 LAS2Q8IYD9 372 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 TAGAPQ8N103 731 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SYT14Q8NB59 555 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 PPA2Q9H2U2 334 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.7□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FFAR1O14842 300 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SPINT1O43278 529 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 SH3BP5O60239 455 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 RHOP08100 348 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 XCR1P46094 333 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 INPP1P49441 399 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CRISP1P54107 249 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 LIM2P55344 173 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 UBE3AQ05086 875 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZNF33BQ06732 778 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CNTN1Q12860 1018 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 HSPB3Q12988 150 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 KLHL12Q53G59 568 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 KLHL22Q53GT1 634 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
UBAP1-201ENST00000297661 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms