RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 WDR45Q9Y484 360 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 TMEM131Q92545 1883 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 UNC13CQ8NB66 2214 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CLDN4O14493 209 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 LAMTOR5O43504 91 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 UGT2B17O75795 530 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 LGI1O95970 557 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 ALOX5P09917 674 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CT62P0C5K7 136 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 ALAS2P22557 587 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CDK5R2Q13319 367 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CNPY1Q3B7I2 92 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 OR6T1Q8NGN1 323 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 FNDC11Q9BVV2 318 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 PINK1Q9BXM7 581 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 RAB33BQ9H082 229 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 MAT2BQ9NZL9 334 aa13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 ASXL3Q9C0F0 2248 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 OR10H3O60404 316 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 SEMA7AO75326 666 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 NSA2O95478 260 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 ANGPTL1O95841 491 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 SLC35E2P0CK97 266 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 ACP2P11117 423 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 SOX18P35713 384 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CCNJQ5T5M9 372 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 GARNL3Q5VVW2 1013 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 NIPAL1Q6NVV3 410 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 OR52P1PQ8NH57 321 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 GPR151Q8TDV0 419 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 TSC22D3Q99576 134 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 EPB41L1Q9H4G0 881 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 NDOR1Q9UHB4 597 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 KCND3Q9UK17 655 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 A0A087WV62 115 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 OR2W5A6NFC9 320 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 TRIM64A6NGJ6 449 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 H3BSA7 217 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CASC3O15234 703 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 PLOD3O60568 738 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 OR2B3O76000 313 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 GASTP01350 101 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 FMO3P31513 532 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 LIMS1P48059 325 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 GABRA4P48169 554 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 SMIM11AP58511 58 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 GRM7Q14831 915 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 GPR68Q15743 365 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 NEDD8Q15843 81 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 FHL5Q5TD97 284 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 KCTD8Q6ZWB6 473 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 VWA5B2Q8N398 1253 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 COX18Q8N8Q8 333 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 OR6C4Q8NGE1 309 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 PIGKQ92643 395 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 UBE2FQ969M7 185 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 PIGUQ9H490 435 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 KLHL28Q9NXS3 571 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 TMEM9Q9P0T7 183 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 ZNF232Q9UNY5 417 aa13.65□□□□□ -0.22
NICN1-201ENST00000273598 TMEM150CB9EJG8 249 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 FRS3O43559 492 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 PCDHGA12O60330 932 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 EPPINO95925 133 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 PAX7P23759 505 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 HOXA6P31267 233 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 ALDH3B2P48448 385 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 BTG2P78543 158 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 HSD11B2P80365 405 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 BROXQ5VW32 411 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 TTLL10Q6ZVT0 673 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 GPR141Q7Z602 305 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 PEX5LQ8IYB4 626 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 CDRT4Q8N9R6 151 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 PIK3R3Q92569 461 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 CCDC90BQ9GZT6 254 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 FSCN3Q9NQT6 498 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 SLC1A7O00341 560 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 XPNPEP2O43895 674 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 SLITRK5O94991 958 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 GIMD1P0DJR0 217 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 POU1F1P28069 291 aa13.64□□□□□ -0.23
NICN1-201ENST00000273598 RFX3P48380 749 aa13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms