RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 GIMAP4Q9NUV9 329 aa23.26■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 CKAP5Q14008 2032 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 SZT2Q5T011 3432 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 A0A0X1KG70 313 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 HCN1O60741 890 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 PSKH1P11801 424 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 FCARP24071 287 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 ZNF234Q14588 700 aa23.25■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 FAM129CQ86XR2 697 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 Q8N402 240 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 MORN4Q8NDC4 146 aa23.25■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 RFXAPO00287 272 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 HPGDSO60760 199 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 GZMKP49863 264 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 PPP3R1P63098 170 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 CNTN1Q12860 1018 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 SHFQ7M4L6 423 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 PEX5LQ8IYB4 626 aa23.25■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 F2RL3Q96RI0 385 aa23.25■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 HTR2BP41595 481 aa23.24■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa23.24■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 TIGD3Q6B0B8 471 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 HMGN2P46Q86SG4 172 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 OR5D16Q8NGK9 328 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 TMEM163Q8TC26 289 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 OR8D1Q8WZ84 308 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 UFD1Q92890 307 aa23.24■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 FNDC11Q9BVV2 318 aa23.24■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 OR2AG1Q9H205 316 aa23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 EGLN3Q9H6Z9 239 aa23.24■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 LIMS4P0CW20 117 aa23.24■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 C19orf18Q8NEA5 215 aa23.24■■□□□ 1.31
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LMO2-201ENST00000257818 GDE1Q9NZC3 331 aa23.23■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa23.23■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 PRODHO43272 600 aa23.22■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 PROM1O43490 865 aa23.22■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 CCT3P49368 545 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 SMSP52788 366 aa23.22■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 TNK1Q13470 666 aa23.22■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 ANKRD53Q8N9V6 530 aa23.22■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 TMEM145Q8NBT3 493 aa23.22■■□□□ 1.31
LMO2-201ENST00000257818 OR6T1Q8NGN1 323 aa23.22■■□□□ 1.31
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