RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.74□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.74□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 RNF122Q9H9V4 155 aa14.74□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.72□□□□□ -0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 SPACA6W5XKT8 324 aa14.71□□□□□ -0.05
SPCS1-201ENST00000233025 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 DLX3O60479 287 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ERLIN1O75477 346 aa14.7□□□□□ -0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GNAZP19086 355 aa14.7□□□□□ -0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 GZMKP49863 264 aa14.7□□□□□ -0.06
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