RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 XKP51811 444 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 LIM2P55344 173 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 RAB8AP61006 207 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 HSPB3Q12988 150 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CDK5R2Q13319 367 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 NADK2Q4G0N4 442 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 TCTE1Q5JU00 501 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CDC73Q6P1J9 531 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CD300LDQ6UXZ3 194 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SLC35F3Q8IY50 421 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 OR2L13Q8N349 312 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 DNAJC22Q8N4W6 341 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 AMER3Q8N944 861 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 KCT2Q8NC54 265 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 NUP43Q8NFH3 380 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 OR4C6Q8NH72 309 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF675Q8TD23 568 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 XAGE5Q8WWM1 108 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 OIT3Q8WWZ8 545 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 TMEM19Q96HH6 336 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF285Q96NJ3 590 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 NRTNQ99748 197 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 BCL7BQ9BQE9 202 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 OR51I1Q9H343 314 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 FBXW2Q9UKT8 454 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 TMCC3Q9ULS5 477 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 BSNQ9UPA5 3926 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1W2PRQ8 180 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ENO4A6NNW6 628 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 RFPL3O75679 317 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 PRKACGP22612 351 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ACP1P24666 158 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 GPR3P46089 330 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 MAN2A2P49641 1150 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 MVKQ03426 396 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 RUNX2Q13950 521 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 DGCR6Q14129 220 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 DUSP7Q16829 419 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 GPR141Q7Z602 305 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ARL14Q8N4G2 192 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 STACQ99469 402 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CDC6Q99741 560 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 DUSP21Q9H596 190 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 KIF17Q9P2E2 1029 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SATB2Q9UPW6 733 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SH3GLB1Q9Y371 365 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 A0A0J9YVX5 310 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 HYKKA2RU49 373 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SH3D21A4FU49 640 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 FAAHO00519 579 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CYR61O00622 381 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 BCKDKO14874 412 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 PPM1DO15297 605 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SLC28A2O43868 658 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 PRAMEF10O60809 474 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 B4GALT2O60909 372 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CCNB2O95067 398 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CPNE6O95741 557 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ADAP00813 363 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 BCHEP06276 602 aa9.98□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 MSL3P1P0C860 447 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147 ms