RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031377.8

Scarb2-201, Transcript of Lysosome membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scarb2, Length 4,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mettl15Q9DCL4 406 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tmem176aQ9DCS1 244 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Adam21Q9JI76 729 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mocs2Q9Z223 189 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nkx1-1G3UXB3 402 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nudt19P11930 357 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 FgrP14234 517 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Adamts15P59384 950 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hsd17b3P70385 305 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Crtc2Q3U182 692 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Eri2Q5BKS4 688 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Taar7dQ5QD10 358 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Xrcc1Q60596 631 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Acvr1bQ61271 505 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 ChdhQ8BJ64 596 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tmem17Q8K0U3 198 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tmem185bQ8R3R5 350 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr77Q8VEY9 312 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr692Q8VF03 329 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr1391Q8VFA4 311 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 RragcQ99K70 398 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rnf128Q9D304 428 aa12.85□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 BC035947B2RQY6 695 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 9330159F19RikD3Z623 648 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm3594E9Q2A7 267 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 GzmeP08884 248 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Znf703P0CL69 594 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nr4a1P12813 601 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bmp7P23359 430 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ntsr2P70310 416 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ugt2b36Q3UEP4 530 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ankrd28Q505D1 1053 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dcdc2Q5DU00 475 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rnase12Q5GAM8 145 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp180Q6NZI9 655 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Alg8Q6P8H8 526 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sox11Q7M6Y2 395 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zcchc4Q8BKW4 512 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mnd1Q8K396 205 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Qrsl1Q9CZN8 525 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Get4Q9D1H7 327 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Phf6Q9D4J7 364 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rhox2aQ9D4Y3 191 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 TescQ9JKL5 214 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Scarb2O35114 478 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Man2b2O54782 1018 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kcnj1O88335 372 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cd14P10810 366 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Etv2P41163 335 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tas2r7P59530 312 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Six5P70178 719 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hoxb13P70321 286 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Opa3Q505D7 179 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 C1qtnf6Q6IR41 264 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 NapepldQ8BH82 396 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pdcd10Q8VE70 212 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr109Q8VG96 314 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lims2Q91XD2 341 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ttc9bQ9D6E4 239 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tmigd1Q9D7L8 261 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nrg4Q9WTX4 115 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Itgb6Q9Z0T9 787 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Espl1P60330 2118 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Megf6Q80V70 1572 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm6619F6URP1 175 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 P01668 110 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Apoc2Q05020 97 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cd244Q07763 397 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 DbhQ64237 622 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tha1Q6XPS7 400 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Leng9Q8BTN6 485 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 PigzQ8BTP0 560 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr63Q8VBW9 316 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ccdc71Q8VEG0 433 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Olfr808Q8VGI8 312 aa12.84□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam209A2APA5 170 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp54E9PW05 585 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 GcgP55095 180 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 UrodP70697 367 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rnf180Q3U827 592 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cars2Q8BYM8 551 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Faim2Q8K097 317 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MepceQ8K3A9 666 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Oas1hQ8VI97 369 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Prelid3bQ9CYY7 195 aa12.83□□□□□ -0.35
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cela3aA2A9U8 283 aa12.83□□□□□ -0.36
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ccl26F8VQM2 93 aa12.83□□□□□ -0.36
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gpr50O88495 591 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.1 ms