RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TSLPQ969D9 159 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC47A1Q96FL8 570 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35A4Q96G79 324 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CHID1Q9BWS9 393 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LOXL2Q9Y4K0 774 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM229AB2RXF0 380 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 M0QX08 132 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MEN1O00255 615 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC28A2O43868 658 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PGM3O95394 542 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNA16P05015 189 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CYBRD1Q53TN4 286 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 HMBOX1Q6NT76 420 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 OVCH1Q7RTY7 1134 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKFN1Q8N957 763 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PLPP5Q8NEB5 264 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52R1Q8NGF1 315 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 PMEPA1Q969W9 287 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TAMM41Q96BW9 452 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 VN1R1Q9GZP7 353 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ADPRHL2Q9NX46 363 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MKL2Q9ULH7 1088 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 TPST1O60507 370 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 COQ9O75208 318 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 AGR2O95994 175 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ZGLP1P0C6A0 271 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 NR2F1P10589 423 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 ACP2P11117 423 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 FCGR1AP12314 374 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K8P41279 467 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 OCA2Q04671 838 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 FUT7Q11130 342 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 CDRT4Q8N9R6 151 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LRFN5Q96NI6 719 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL2L10Q9HD36 194 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 C14orf105Q9NVL8 296 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPT1Q9Y234 373 aa23.21■■□□□ 1.31
CAPNS1-215ENST00000628018 VSTM2BA6NLU5 285 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 HRKO00198 91 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 MT-CO3P00414 261 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMG1P04279 462 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ITIH1P19827 911 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 FASP25445 335 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CRISP3P54108 245 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN6P56747 220 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENOWP63302 87 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 GNA13Q14344 377 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS58Q8IYP2 241 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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CAPNS1-215ENST00000628018 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A1Q9H2B4 701 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGUQ9H490 435 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 RUBCNLQ9H714 662 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 GIN1Q9NXP7 522 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf105B2RV13 164 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SUV39H1O43463 412 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CSO75390 466 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNA14P01570 189 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ALBP02768 609 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 OPN1SWP03999 348 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 TNNI3P19429 210 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SSTR4P31391 388 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 VHLP40337 213 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ETV5P41161 510 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB15P59190 212 aa23.19■■□□□ 1.3
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CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP5Q16690 384 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ATAD3BQ5T9A4 648 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 LCN10Q6JVE6 187 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS13Q6UX07 377 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB11FIP2Q7L804 512 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 HSH2DQ96JZ2 352 aa23.19■■□□□ 1.3
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CAPNS1-215ENST00000628018 DOHHQ9BU89 302 aa23.19■■□□□ 1.3
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CAPNS1-215ENST00000628018 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 EXD2Q9NVH0 621 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PROB1E7EW31 1015 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE9AO76083 593 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 MT-ND1P03886 318 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPNS1P04632 268 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRM4P08173 479 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK4P11802 303 aa23.18■■□□□ 1.3
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