RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.05□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 C2orf72A6NCS6 295 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 CAPN14A8MX76 684 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 PPP6CO00743 305 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 IL2RAP01589 272 aa11.04□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 CCNG1P51959 295 aa11.04□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11.04□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 PM20D2Q8IYS1 436 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 C9orf106Q8NAJ2 232 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 HGDQ93099 445 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 NODALQ96S42 347 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 DLL4Q9NR61 685 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 MAT2BQ9NZL9 334 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 XPR1Q9UBH6 696 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.04□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 CD8B2A6NJW9 211 aa11.03□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 CBX7O95931 251 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
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CTIF-208ENST00000590422 FOXF2Q12947 444 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 SLC48A1Q6P1K1 146 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 LETMD1Q6P1Q0 360 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 METTL4Q8N3J2 472 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ADCY4Q8NFM4 1077 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 OR4F6Q8NGB9 312 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 LINC01560Q8TB33 94 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 OMA1Q96E52 524 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 HBEGFQ99075 208 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 NTMT1Q9BV86 223 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 BRINP2Q9C0B6 783 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 SERHLQ9NQF3 203 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 JKAMPQ9P055 326 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 ZNF639Q9UID6 485 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 PLLPQ9Y342 182 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa11.03□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 DNHD1Q96M86 4753 aa11.02□□□□□ -0.64
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PPR1 153 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 B4DXG7 233 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 STX16O14662 325 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 UGT2B11O75310 529 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 NME6O75414 186 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ATE1O95260 518 aa11.02□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ATP1B1P05026 303 aa11.02□□□□□ -0.65
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