RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CASP9	P55211	416 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	P2RX3	P56373	397 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DUSP2	Q05923	314 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	TEAD4	Q15561	434 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SVOPL	Q8N434	492 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	NCLN	Q969V3	563 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MAP3K3	Q99759	626 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CHID1	Q9BWS9	393 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	STMN3	Q9NZ72	180 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	B4GAT1	O43505	415 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PRKD3	O94806	890 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SERPINA1	P01009	418 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	HTR1A	P08908	422 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RYK	P34925	604 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SOAT1	P35610	550 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PRIM2	P49643	509 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	HSPB3	Q12988	150 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RUNX2	Q13950	521 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	VEZF1	Q14119	521 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RFX4	Q33E94	735 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PLK5	Q496M5	336 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DEFB134	Q4QY38	66 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CCDC58	Q4VC31	144 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MANEA	Q5SRI9	462 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SAXO2	Q658L1	398 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF130	Q86XS8	419 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MAL2	Q969L2	176 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	C10orf90	Q96M02	699 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF145	Q96MT1	663 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		14.49	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SCN2A	Q99250	2005 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318		A0A1W2PS29	197 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	URAD	A6NGE7	173 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CENPX	A8MT69	81 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	KCNK2	O95069	426 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	C9	P02748	559 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RAP2A	P10114	183 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ALOX12	P18054	663 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	RRM2	P31350	389 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CRAT	P43155	626 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CRYBA2	P53672	197 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	GFER	P55789	205 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CEBPE	Q15744	281 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	MAPK11	Q15759	364 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DUSP7	Q16829	419 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	GALNT10	Q86SR1	603 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CCDC103	Q8IW40	242 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SHISA5	Q8N114	240 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	HTRA1	Q92743	480 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	NEURL3	Q96EH8	262 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SERINC2	Q96SA4	455 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		14.48	□□□□□ -0.09
DDX39A-209	ENST00000589318	SPTB	P11277	2137 aa		14.47	□□□□□ -0.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms