RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CREB1P16220 341 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA1024LP59773 190 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OPN5Q6U736 354 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 S100A7AQ86SG5 101 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF709Q8N972 641 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CA14Q9ULX7 337 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 PSAT1Q9Y617 370 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SEC14L5O43304 696 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 MYF6P23409 242 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ST3GAL4Q11206 333 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR4D1Q15615 310 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM107Q6UX40 140 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ISCA2Q86U28 154 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF366Q8N895 744 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 KCT2Q8NC54 265 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ARL5BQ96KC2 179 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TMED9Q9BVK6 235 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ACSS2Q9NR19 701 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 NANSQ9NR45 359 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RBBP9O75884 186 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 PRLP01236 227 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 MT-ND1P03886 318 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF28P17035 718 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CEBPBP17676 345 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CDK10Q15131 360 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ULK3Q6PHR2 472 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 IL17RCQ8NAC3 791 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TBX5Q99593 518 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR10A4Q9H209 315 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF69Q9UC07 566 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF35P13682 527 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TNFSF4P23510 183 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 HK3P52790 923 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 NPRL3Q12980 569 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CHAF1BQ13112 559 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GNMTQ14749 295 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RGNQ15493 299 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 MICAQ29983 383 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 BCL7AQ4VC05 210 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 NKD1Q969G9 470 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL15Q96M94 604 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 F2RL3Q96RI0 385 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 KCNA7Q96RP8 456 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 NUDT15Q9NV35 164 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 MED17Q9NVC6 651 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 A0A075B6Q4 140 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 OR5K3A6NET4 321 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ITGA3P26006 1051 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RAB38P57729 211 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SEMG2Q02383 582 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RAB11BQ15907 218 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB134Q4QY38 66 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RNF220Q5VTB9 566 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM25Q86YD3 366 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms