RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	NEK11	Q8NG66	645 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PSMG2	Q969U7	264 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	GIMAP5	Q96F15	307 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	UHRF2	Q96PU4	802 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	COMMD8	Q9NX08	183 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PTPRD	P23468	1912 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	IGF2R	P11717	2491 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MAGEB16	A2A368	324 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SHISA7	A6NL88	538 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089		A8MVM7	634 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089		K7ERI5	159 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ADAM12	O43184	909 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	B4GALT5	O43286	388 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB14	O43829	449 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PCDH7	O60245	1069 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ACSL4	O60488	711 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLITRK3	O94933	977 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	YES1	P07947	543 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ODC1	P11926	461 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	GP1BB	P13224	206 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	KCNE1	P15382	129 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FER	P16591	822 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	TYMP	P19971	482 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	RPA1	P27694	616 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SMS	P52788	366 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	DLX5	P56178	289 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ARPP19	P56211	112 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	GALK2	Q01415	458 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLC3A1	Q07837	685 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LCP2	Q13094	533 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	P2RY6	Q15077	328 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PON2	Q15165	354 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PPA1	Q15181	289 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	XKR4	Q5GH76	650 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	RAB12	Q6IQ22	244 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MACC1	Q6ZN28	852 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089		Q6ZS52	159 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FCRLA	Q7L513	359 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SFRP1	Q8N474	314 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	AMER3	Q8N944	861 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	NODAL	Q96S42	347 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	LPAR4	Q99677	370 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	GPR173	Q9NS66	373 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	EXOC1	Q9NV70	894 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	PROCR	Q9UNN8	238 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	DOCK7	Q96N67	2140 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089		E9PAM4	449 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	FAM72C	H0Y354	149 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	KIF5C	O60282	957 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-223	ENST00000536089	HSF2BP	O75031	334 aa		3.61	□□□□□ -1.83

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