RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PFASO15067 1338 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0A6YYD4 124 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLN5O75503 358 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN9O75954 239 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TGDSO95455 350 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUDT14O95848 222 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV3-48P01763 117 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FYNP06241 537 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPT2P23786 658 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPA4P34932 840 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAA4P35542 130 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LONP1P36776 959 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIR3DL2P43630 455 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB28P51157 221 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ROR1Q01973 937 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CUL4AQ13619 759 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GGTLC2Q14390 218 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HEPACAMQ14CZ8 416 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSMD6Q15008 389 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT31Q15323 416 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1C1Q15619 314 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SULT1C3Q6IMI6 304 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STOX1Q6ZVD7 989 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OAFQ86UD1 273 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C17orf64Q86WR6 236 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALLCQ8N6M5 410 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPV3Q8NET8 790 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HEXDCQ8WVB3 486 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM158Q8WZ71 300 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FRZBQ92765 325 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HAVCR1Q96D42 359 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRAM1Q96QH2 718 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSX3Q99909 188 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF559Q9BR84 538 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR174Q9BXC1 333 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPNS1Q9H2V7 528 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABCB8Q9NUT2 735 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEK2Q9NYT0 353 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EMCNQ9ULC0 261 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDH10Q9Y6N8 788 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHANK1Q9Y566 2161 aa0.13□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSAPA4D1B5 854 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NKX2-6A6NCS4 301 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TUBAL3A6NHL2 446 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEI4A8MW99 385 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IMPA2O14732 288 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYT7O43581 403 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TYROBPO43914 113 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN2O60636 221 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PNPP00491 289 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EZRP15311 586 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RXRGP48443 463 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRISP3P54108 245 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTA1P68133 377 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CETN1Q12798 172 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPHARQ15513 63 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGFBP7Q16270 282 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UGCGQ16739 394 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB116Q30KQ4 102 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RILPL1Q5EBL4 403 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EOGTQ5NDL2 527 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERMARDQ5T6L9 678 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STEAP1BQ6NZ63 245 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MFSD7Q6UXD7 560 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCOLN2Q8IZK6 566 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC5Q8N0Z6 440 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C6orf223Q8N319 242 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POGLUT1Q8NBL1 392 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51G1Q8NGK1 321 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2L8Q8NGY9 312 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBALD1Q8TB05 177 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SETD6Q8TBK2 473 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXO25Q8TCJ0 367 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STARD8Q92502 1023 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIT1Q92963 219 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEIL2Q969S2 332 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RMDN2Q96LZ7 410 aa0.12□□□□□ -2.39
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms