RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0B4J203 849 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC162PA2VCL2 907 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPAG7O75391 227 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GRAP2O75791 330 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A27O95847 323 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RHOXF2BP0C7M4 288 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 P0C880 135 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CETN1Q12798 172 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DPYSL3Q14195 570 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYPL1Q16563 259 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARMC4Q5T2S8 1044 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf189Q5VU69 101 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM46CQ5VWP2 391 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAET1LQ5VY80 246 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UFSP1Q6NVU6 142 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAPNS2Q96L46 248 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD274Q9NZQ7 290 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GGA2Q9UJY4 613 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 THSD7BQ9C0I4 1608 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KMT2DO14686 5537 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FLRT2O43155 660 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBL1XO60907 577 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PEX14O75381 377 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF254O75437 659 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRB1P04280 392 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CSH1P0DML2 217 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CSH2P0DML3 217 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPP1P10451 314 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OTX2P32243 289 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPL32P62910 135 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM95Q3KNT9 176 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MCOLN2Q8IZK6 566 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR52P1PQ8NH57 321 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RFESDQ8TAC1 157 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FNDC8Q8TC99 324 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXT2Q93063 718 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GCNAQ96QF7 691 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABHD1Q96SE0 405 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CENPMQ9NSP4 180 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATG4BQ9Y4P1 393 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C16orf90A8MZG2 172 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GFYI3L273 518 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CISD3P0C7P0 127 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCF4P15884 667 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABRQ12979 859 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC73Q5JTD7 316 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LY6G6FQ5SQ64 297 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAP25Q8TEE9 199 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FGGYQ96C11 551 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FUT8Q9BYC5 575 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CXXC4Q9H2H0 198 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSPAN9O75954 239 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALCAMQ13740 583 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MEF2DQ14814 521 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 P2RY14Q15391 338 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC57Q2TAC2 916 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SASS6Q6UVJ0 657 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2AP1Q8NGE2 309 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MINDY3Q9H8M7 445 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDE7BQ9NP56 450 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIRT7Q9NRC8 400 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDRG1Q9NUG6 133 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EMCNQ9ULC0 261 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FZR1Q9UM11 496 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0A6YYD4 124 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1W2PPE2 198 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A1W2PR64 198 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A6NCN8 305 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKDD1BA6NHY2 528 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMA3P25788 255 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GJB2P29033 226 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MC5RP33032 325 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DLSTP36957 453 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHAF1BQ13112 559 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMD6Q15008 389 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD226Q15762 336 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF880Q6PDB4 577 aa0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.5 ms