RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516524.1

RNU6-964P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 964, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-964P, Length 69 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-964P-201ENST00000516524 POT1Q9NUX5 634 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 FRG2CA6NGY1 282 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SHISA7A6NL88 538 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 WDR1O75083 606 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 FCER2P06734 321 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PRPS2P11908 318 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 TBXA2RP21731 343 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPX3P22352 226 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 HTR5AP47898 357 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ENPEPQ07075 957 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 CNTN1Q12860 1018 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 HAGHQ16775 308 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 DDI1Q8WTU0 396 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 C17orf50Q8WW18 174 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ST8SIA1Q92185 356 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 FAM3CQ92520 227 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 RAB1CQ92928 201 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SARAFQ96BY9 339 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 IL12RB2Q99665 862 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 FUCA2Q9BTY2 467 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 TREM1Q9NP99 234 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 GHRLQ9UBU3 117 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 EMCNQ9ULC0 261 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ARID2Q68CP9 1835 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 A0A0G2JK05 382 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 C12orf71A8MTZ7 269 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 TCP10L2B9ZVM9 353 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SH2D1BO14796 132 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 KIAA0513O60268 411 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 HPGDP15428 266 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 LHCGRP22888 699 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 RORAP35398 523 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SGSHP51688 502 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 TGFBIQ15582 683 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SBK1Q52WX2 424 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 TEX44Q53QW1 395 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 CORO6Q6QEF8 472 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 MOB3BQ86TA1 216 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PYROXD2Q8N2H3 581 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 LRTM2Q8N967 370 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 OR13C3Q8NGS6 347 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 UPRTQ96BW1 309 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 NSL1Q96IY1 281 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 LURAP1Q96LR2 239 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM175Q9BSA9 504 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 NARFLQ9H6Q4 476 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 IL20Q9NYY1 176 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 POLKQ9UBT6 870 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 R4GN57 208 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 V9GYY5 206 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF840PA6NDX5 716 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PROB1E7EW31 1015 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PDLIM1O00151 329 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 OR7A17O14581 309 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 CABYRO75952 493 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 OR2F2O95006 317 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 CST1P01037 141 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 SERPIND1P05546 499 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 H2BFMP0C1H6 154 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 ACADSP16219 412 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 PCMT1P22061 227 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 CA6P23280 308 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-964P-201ENST00000516524 GLRA1P23415 457 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms