RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490439.1

NUP205-208, Transcript of nucleoporin 205, humanhuman

TSL 3

Gene NUP205, Length 653 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205-208ENST00000490439 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 PRR31Q5SQ13 230 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 RINLQ6ZS11 566 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SLCO2A1Q92959 643 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ART5Q96L15 291 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 EHD1Q9H4M9 534 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 LYRM4Q9HD34 91 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 PSAT1Q9Y617 370 aa6.96□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CACNA1CQ13936 2221 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TP53I11O14683 189 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 LRATO95237 230 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ETHE1O95571 254 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CCDC166P0CW27 439 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 GDF1P27539 372 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SERPINB3P29508 390 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 MASP1P48740 699 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ASCL1P50553 236 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ATP6V0D1P61421 351 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 DR1Q01658 176 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CHIT1Q13231 466 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SLAMF1Q13291 335 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 BIKQ13323 160 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 KEAP1Q14145 624 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TOMM20Q15388 145 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.35e-7■□□□□ 8.6
NUP205-208ENST00000490439 MPEG1Q2M385 716 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 PIGGQ5H8A4 983 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TMEM198Q66K66 360 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 STEAP4Q687X5 459 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 RTL6Q6ICC9 239 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 MED27Q6P2C8 311 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TAGAPQ8N103 731 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SLC35F6Q8N357 371 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 NUBPLQ8TB37 319 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 FAM222BQ8WU58 562 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CDKL2Q92772 493 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 DIO2Q92813 273 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ESAMQ96AP7 390 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ZNF597Q96LX8 424 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 DOHHQ9BU89 302 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 DERL2Q9GZP9 239 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 LIME1Q9H400 295 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 RHOJQ9H4E5 214 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 RASSF1Q9NS23 344 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CNIH4Q9P003 139 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 PHF11Q9UIL8 331 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SNX12Q9UMY4 172 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.95□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 TUBAL3A6NHL2 446 aa6.94□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 A6NNC1 897 aa6.94□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 CAPN14A8MX76 684 aa6.94□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.94□□□□□ -1.3
NUP205-208ENST00000490439 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms