RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CLLU1Q5K131 121 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 IDNKQ5T6J7 187 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RTL4Q6ZR62 310 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CPA6Q8N4T0 437 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SLC9A6Q92581 669 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SORCS2Q96PQ0 1159 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 LRG1P02750 347 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 C8AP07357 584 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RHCEP18577 417 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CFL1P23528 166 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NTRK2Q16620 822 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MPP7Q5T2T1 576 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CEACAM20Q6UY09 585 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 DEF8Q6ZN54 512 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 L3MBTL4Q8NA19 623 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 OR2A12Q8NGT7 310 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ST8SIA2Q92186 375 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MED8Q96G25 268 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SAMD11Q96NU1 681 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NLNQ9BYT8 704 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SAP130Q9H0E3 1048 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 OR51J1Q9H342 316 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC11Q9NVH1 559 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GFYI3L273 518 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PRKYO43930 277 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 LILRB3O75022 631 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 C6orf47O95873 294 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HLA-DQB1P01920 261 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ACRP10323 421 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CELP19835 753 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SRP9P49458 86 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CTSCP53634 463 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GPR68Q15743 365 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 DCST1Q5T197 706 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ANXA8L1Q5VT79 327 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RAET1GQ6H3X3 334 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CNKSR3Q6P9H4 555 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GPR155Q7Z3F1 870 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 COQ10AQ96MF6 247 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 LINC00052Q96N35 136 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GSX2Q9BZM3 304 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CHST8Q9H2A9 424 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 GPATCH2Q9NW75 528 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HCN3Q9P1Z3 774 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CLCA2Q9UQC9 943 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PPIL1Q9Y3C6 166 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CCDC88CQ9P219 2028 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 USP34Q70CQ2 3546 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 C1orf226A1L170 272 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CD8B2A6NJW9 211 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 M0R233 179 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PPM1BO75688 479 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 C8GP07360 202 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CD8BP10966 210 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CLCNKAP51800 687 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TUSC1Q2TAM9 212 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 FAM180BQ6P0A1 224 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 IL20RBQ6UXL0 311 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 FAM92BQ6ZTR7 304 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 HUS1BQ8NHY5 278 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RBP7Q96R05 134 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ15Q99712 375 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ATF6BQ99941 703 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RNF208Q9H0X6 261 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NT5DC2Q9H857 520 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 ENAMQ9NRM1 1142 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 THSD1Q9NS62 852 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 TAS2R7Q9NYW3 318 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 CLEC4AQ9UMR7 237 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 QSOX1O00391 747 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PRMT3O60678 531 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 LEFTY1O75610 366 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 POP4O95707 220 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
NISCH-212ENST00000488380 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms