RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM222BQ8WU58 562 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 HGDQ93099 445 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHL29Q96CT2 875 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 OMA1Q96E52 524 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC46Q96FV0 321 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 NODALQ96S42 347 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 HBEGFQ99075 208 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 PAFAH2Q99487 392 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 FUT8Q9BYC5 575 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 PLLPQ9Y342 182 aa15.44■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 C2orf72A6NCS6 295 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CD8B2A6NJW9 211 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 SNPHO15079 494 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CBX7O95931 251 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CD99P14209 185 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CNTFP26441 200 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 DEKP35659 375 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 PTGDSP41222 190 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 NAGLUP54802 743 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CDH13P55290 713 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP4K2Q12851 820 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 RELL1Q8IUW5 271 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 C9orf106Q8NAJ2 232 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 OR52R1Q8NGF1 315 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 OR1J4Q8NGS1 313 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TM4SF18Q96CE8 201 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 OSBPL11Q9BXB4 747 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF639Q9UID6 485 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MAPRE3Q9UPY8 281 aa15.43■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 A8MT66 165 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 UGT2B11O75310 529 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 GUCY1B2O75343 617 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 SBK3P0C264 359 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 PCSK2P16519 638 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 NAGAP17050 411 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MED12LQ86YW9 2145 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CTHRC1Q96CG8 243 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 SERHLQ9NQF3 203 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF225Q9UK10 706 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CFL2Q9Y281 166 aa15.42■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAMEF25A6NGN4 478 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 ACOX3O15254 700 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 ICOSLGO75144 302 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CDH16O75309 829 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 OTCP00480 354 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 RHOXF2BP0C7M4 288 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 COL6A2P12110 1019 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 KLK2P20151 261 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 DNASE1P24855 282 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CTSSP25774 331 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 SLCO1A2P46721 670 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 ALDH9A1P49189 494 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 SERPINB9P50453 376 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.063e-17■■■■■ 28.4
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF681Q96N22 645 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 CALHM2Q9HA72 323 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 BRF2Q9HAW0 419 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 FETUBQ9UGM5 382 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 SNX6Q9UNH7 406 aa15.41■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.4■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.4■□□□□ 0.06
SKIV2L-211ENST00000485349 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms