RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474929.1

USP54-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 4

Gene USP54, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-211ENST00000474929 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PLCZ1Q86YW0 608 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 METTL25Q8N6Q8 603 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PRELID2Q8N945 189 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 RDH11Q8TC12 318 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 BIRC8Q96P09 236 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 NDNQ99608 321 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 HIST1H2AJQ99878 128 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 H2AFJQ9BTM1 129 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.13□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 LRP5LA4QPB2 252 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ESPNB1AK53 854 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PSTPIP1O43586 416 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 LDB3O75112 727 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 C8GP07360 202 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 NPPBP16860 134 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PTNP21246 168 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PRTN3P24158 256 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 GALNSP34059 522 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 HERVK_113P63132 956 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ERVK-8P63133 956 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 NAE1Q13564 534 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 MORF4L2Q15014 288 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 Q6ZSR9 355 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 C1QL4Q86Z23 238 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 BBOF1Q8ND07 529 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 OR2L5Q8NG80 312 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 OR51F2Q8NH61 342 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 MRAPQ8TCY5 172 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 KCNJ9Q92806 393 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 SNF8Q96H20 258 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 CSF3RQ99062 836 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 INPP5KQ9BT40 448 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 FKRPQ9H9S5 495 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 MYNNQ9NPC7 610 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.12□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 C4orf51C9J302 202 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 E7EQL1 145 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 SEC14L5O43304 696 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ICOSLGO75144 302 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PPM1BO75688 479 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 KNG1P01042 644 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 TFP02787 698 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 MSMBP08118 114 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 NUDT17P0C025 328 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ABCD3P28288 659 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 AP1S2P56377 157 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ITGADQ13349 1161 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 CTBP1Q13363 440 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 RAET1LQ5VY80 246 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 DUPD1Q68J44 220 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 BRICD5Q6PL45 260 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 BBS12Q6ZW61 710 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 NANPQ8TBE9 248 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 LPGAT1Q92604 370 aa7.11□□□□□ -1.27
USP54-211ENST00000474929 SLC25A28Q96A46 364 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms