RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PISD	Q9UG56	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	RAD51B	O15315	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CREG1	O75629	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	REC8	O95072	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	BCL10	O95999	233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	IL1B	P01584	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GP1BA	P07359	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LIPC	P11150	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	GOT1	P17174	413 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CDH11	P55287	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FZD2	Q14332	565 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM17-208	ENST00000467080	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63	1e-6	■■■■□ 20.3
RBM17-208	ENST00000467080	UBE4B	O95155	1302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	STX6	O43752	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	CTSL	P07711	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	TNNI1	P19237	187 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	GNB1	P62873	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	CCL7	P80098	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	SCN1B	Q07699	218 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	BMF	Q96LC9	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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