RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT9Q9BW91 350 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP25Q9NPA2 562 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GIN1Q9NXP7 522 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM247A6NEH6 219 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 HRKO00198 91 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ASNA1O43681 348 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJA2O60884 412 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINA7P05543 415 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ALOX5P09917 674 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GPX2P18283 190 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CPOXP36551 454 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CRATP43155 626 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 KHKP50053 298 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 EMDP50402 254 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MTPNP58546 118 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PSPHP78330 225 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP1A4Q13733 1029 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RGNQ15493 299 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATS1Q496A3 300 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC73Q6P1J9 531 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF130Q86XS8 419 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 KBTBD2Q8IY47 623 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 APCDD1LQ8NCL9 501 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NUBPLQ8TB37 319 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ELP5Q8TE02 316 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 JADE3Q92613 823 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GIMAP5Q96F15 307 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 VSTM2LQ96N03 204 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 STACQ99469 402 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 FOLH1BQ9HBA9 442 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 EQTNQ9NQ60 294 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ADA2Q9NZK5 511 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 POLHQ9Y253 713 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CACNA1AO00555 2505 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 ACOX3O15254 700 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 NKX2-8O15522 239 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 AK1P00568 194 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CLPSP04118 112 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DRD5P21918 477 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 PPICP45877 212 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A2P52569 658 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 UCNP55089 124 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DSTNP60981 165 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF4P78317 190 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC20Q12834 499 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DUSP8Q13202 625 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 EBPQ15125 230 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 RABL3Q5HYI8 236 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF10Q5QP82 559 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINA11Q86U17 422 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms