RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432331.1

LINC00390-201, long intergenic non-protein coding RNA 390, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00390, Length 340 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00390-201ENST00000432331 COX5BP10606 129 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ANXA8P13928 327 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 GABRA1P14867 456 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CPN1P15169 458 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 GABRB1P18505 474 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 FPR3P25089 353 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 NOS3P29474 1203 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CRABP1P29762 137 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 HOXA9P31269 272 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 AKT1P31749 480 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 S100A11P31949 105 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 MNDAP41218 407 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SLC19A1P41440 591 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PTGFRP43088 359 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CRYBB2P43320 205 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 EVX1P49640 407 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 GPR15P49685 360 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 NUDT6P53370 316 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 EPHB3P54753 998 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 DAOAP59103 153 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CDC42P60953 191 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SLC6A3Q01959 620 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZNF33AQ06730 810 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 C2orf80Q0P641 193 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ST3GAL4Q11206 333 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 TWF1Q12792 350 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 GPR176Q14439 515 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PTPRRQ15256 657 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SSX1Q16384 188 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SYTL3Q4VX76 610 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 XKR7Q5GH72 579 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 VITQ6UXI7 678 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 RTL10Q7L3V2 364 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZNF561Q8N587 486 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 OR56B4Q8NH76 319 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 OSTF1Q92882 214 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 USP7Q93009 1102 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CHFRQ96EP1 664 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CXorf58Q96LI9 332 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZNF583Q96ND8 569 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 LRFN5Q96NI6 719 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PEBP4Q96S96 227 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZNF559Q9BR84 538 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CRB3Q9BUF7 120 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 DUSP26Q9BV47 211 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZNF576Q9H609 170 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 XKR8Q9H6D3 395 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 HHATLQ9HCP6 504 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 NANSQ9NR45 359 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 USP3Q9Y6I4 520 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 V9GYQ6 96 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00390-201ENST00000432331 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms