RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372621.8

CTPS1-202, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTPS1, Length 3,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-202ENST00000372621 EGLN3Q9H6Z9 239 aa12.01□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 TRPC4Q9UBN4 977 aa12.01□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 A0A0G2JN53 185 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 KHKP50053 298 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 UBE3AQ05086 875 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SNAPC1Q16533 368 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF628Q5EBL2 1059 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 HMGN2P46Q86SG4 172 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 LAPTM4BQ86VI4 370 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 RDH10Q8IZV5 341 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 GDPD1Q8N9F7 314 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SUN3Q8TAQ9 357 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 RNFT2Q96EX2 444 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 KCTD7Q96MP8 289 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 PHOX2BQ99453 314 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 MARCH7Q9H992 704 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 MYO7AQ13402 2215 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 A0A087WUU8 490 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 HMX3A6NHT5 357 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 LRRTM2O43300 516 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 ADH1CP00326 375 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 P2RY2P41231 377 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 CDK3Q00526 305 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SZRD1Q7Z422 152 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SFTPA1Q8IWL2 248 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 OR8D4Q8NGM9 314 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 CXorf40AQ8TE69 158 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 C17orf62Q9BQA9 187 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SLC22A4Q9H015 551 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SAP130Q9H0E3 1048 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 MMP28Q9H239 520 aa12□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 C4orf51C9J302 202 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 TIMP1P01033 207 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 TSPAN19P0C672 248 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 MYL12AP19105 171 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 GPC1P35052 558 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 TAS2R38P59533 333 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SLAMF1Q13291 335 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 TAB1Q15750 504 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 PINK1Q9BXM7 581 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 KLHL31Q9H511 634 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 CHD7Q9P2D1 2997 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 A0A0G2JPF8 293 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 IRGMA1A4Y4 181 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 FABP12A6NFH5 140 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 DUSP2Q05923 314 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF234Q14588 700 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 UAP1L1Q3KQV9 507 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 DDI2Q5TDH0 399 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 GATAD2AQ86YP4 633 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SYT14Q8NB59 555 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SFXN5Q8TD22 340 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTPS1-202ENST00000372621 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 TRPM6Q9BX84 2022 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 TTC36A6NLP5 189 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 UBXN7O94888 489 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 APOL3O95236 402 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 GABRA5P31644 462 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 PTGER1P34995 402 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 SSR2P43308 183 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 MTNR1AP48039 350 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 FABP5Q01469 135 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-202ENST00000372621 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa11.99□□□□□ -0.49
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