RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 KMOO15229 486 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 REM1O75628 298 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TIMP2P16035 220 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 MAGEA2P43356 314 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CPXM2Q8N436 756 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 DOK4Q8TEW6 326 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GINS4Q9BRT9 223 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FUZQ9BT04 418 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 MED31Q9Y3C7 131 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 H3BNC9 293 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 B3GALT2O43825 422 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF24P17028 368 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA0040Q15053 153 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 LIN54Q6MZP7 749 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SNAPC3Q92966 411 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ACER3Q9NUN7 267 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1B0GVC2 190 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 A6NIN4 97 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CSO75390 466 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GPX5O75715 221 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFV2P19404 249 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 HOXC5Q00444 222 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CDC20Q12834 499 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GPR19Q15760 415 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ASGR2P07307 311 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ANXA3P12429 323 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PRLHRP49683 370 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PDZD3Q86UT5 571 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FANK1Q8TC84 345 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 NR4A3Q92570 626 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 EID2BQ96D98 161 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PITX2Q99697 317 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 COMMD9Q9P000 198 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 FKBP7Q9Y680 259 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PRG6 482 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 AGR2O95994 175 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 EDNRAP25101 427 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ACADLP28330 430 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SKP1P63208 163 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 ILKQ13418 452 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 CPOQ8IVL8 374 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 GID4Q8IVV7 300 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 THSD1Q9NS62 852 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 A0A075B6Q4 140 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 GFYI3L273 518 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 EMC8O43402 210 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 RHOP08100 348 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 BMP1P13497 986 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 DRD2P14416 443 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HK1P19367 917 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 MNDAP41218 407 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HYLS1Q96M11 299 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 OR4K3Q96R72 315 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 GAL3ST1Q99999 423 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 VEGFDO43915 354 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRU-201ENST00000345512 STARP49675 285 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms