RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PLOD3O60568 738 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DPM1O60762 260 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 B4GALT2O60909 372 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LDB3O75112 727 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PGM3O95394 542 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 BCHEP06276 602 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MYF5P13349 255 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ETS2P15036 469 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MC3RP41968 323 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGA1P56199 1179 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD17B7P56937 341 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DAB2P98082 770 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ACY1Q03154 408 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CFHR1Q03591 330 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC13A2Q13183 592 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NKG7Q16617 165 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 IFI44LQ53G44 452 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 VTCN1Q7Z7D3 282 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 STK32CQ86UX6 486 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2L13Q8N349 312 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T29Q8NH02 315 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5K1Q8NHB7 308 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM110BQ8TC76 370 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TMBIM1Q969X1 311 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM19Q96HH6 336 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF597Q96LX8 424 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF570Q96NI8 536 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRN3Q9H3W5 708 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF639Q9UID6 485 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PATE3B3GLJ2 98 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PDLIM1O00151 329 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SOCS2O14508 198 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ACOX3O15254 700 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF17O60258 216 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSBP07858 339 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CKMT1AP12532 417 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NT5EP21589 574 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL7P80098 99 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP2Q05923 314 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SERTAD2Q14140 314 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNAB1Q14722 419 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GUSBP11Q6P575 273 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 LGI4Q8N135 537 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 BBS10Q8TAM1 723 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF675Q8TD23 568 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PROX1Q92786 737 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53INP1Q96A56 240 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NRBF2Q96F24 287 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX11GQ96HA9 241 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 REEP1Q9H902 201 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 NTN4Q9HB63 628 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF21Q9NSA1 209 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PDP2Q9P2J9 529 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 THADAQ6YHU6 1953 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 EYSQ5T1H1 3165 aa9.46□□□□□ -0.89
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF749O43361 778 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MFN2O95140 757 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMG1P04279 462 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms