RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PRKACGP22612 351 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 IGFBP5P24593 272 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SOX18P35713 384 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 XCR1P46094 333 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RAD23AP54725 363 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MYBPC1Q00872 1141 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RFX4Q33E94 735 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PERM1Q5SV97 790 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GPR135Q8IZ08 494 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR1L3Q8NH93 324 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC9A6Q92581 669 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CDS1Q92903 461 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MVB12AQ96EY5 273 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PIP5K1AQ99755 562 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TOR3AQ9H497 397 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FANCEQ9HB96 536 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GIN1Q9NXP7 522 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.83□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF749O43361 778 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ACP2P11117 423 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FOLR1P15328 257 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KCNJ5P48544 419 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CDH12P55289 794 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 STX4Q12846 297 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 EID2Q8N6I1 236 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DOK4Q8TEW6 326 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MBOAT4Q96T53 435 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 NDC1Q9BTX1 674 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TNFRSF11BO00300 401 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ARHGAP33O14559 1287 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CTNSO60931 367 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 COQ9O75208 318 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CPNE6O95741 557 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CLIC3O95833 236 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ALPPP05187 535 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SYPP08247 313 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CT62P0C5K7 136 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 RHCEP18577 417 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 YAP1P46937 504 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 HSD17B7P56937 341 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MGAT2Q10469 447 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SQSTM1Q13501 440 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 DUSP5Q16690 384 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MLIPQ5VWP3 458 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC23A3Q6PIS1 610 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 USP51Q70EK9 711 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF605Q86T29 641 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CTHRC1Q96CG8 243 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC35A4Q96G79 324 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.82□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms