RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 OR4K5Q8NGD3 323 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 OR10G6Q8NH81 332 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 Q96MT0 163 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 OR2A5Q96R48 311 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 SLC38A1Q9H2H9 487 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 FBXO8Q9NRD0 319 aa22.52■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 TAS2R16Q9NYV7 291 aa22.52■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 P2RX6O15547 441 aa22.51■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 TNFSF14O43557 240 aa22.51■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 CPN2P22792 545 aa22.51■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 SLC15A1P46059 708 aa22.51■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 TMEM201Q5SNT2 666 aa22.51■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 ATAD3BQ5T9A4 648 aa22.51■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.51■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa22.5■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 ENTPD6O75354 484 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF311Q5JNZ3 666 aa22.5■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 CD300LDQ6UXZ3 194 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 C16orf62Q7Z3J2 963 aa22.5■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC25A19Q9HC21 320 aa22.5■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.5■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 TUBA1AQ71U36 451 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 MS4A4EQ96PG1 132 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 GIN1Q9NXP7 522 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 SLC13A4Q9UKG4 626 aa22.5■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 GABRG2P18507 467 aa22.49■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 LTBRP36941 435 aa22.49■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 DEFB134Q4QY38 66 aa22.49■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 MORN4Q8NDC4 146 aa22.49■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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TRIM54-201ENST00000296098 SMIM10Q96HG1 83 aa22.48■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.48■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 SEMA4FO95754 770 aa22.48■■□□□ 1.19
TRIM54-201ENST00000296098 HSMCR30P0CW71 290 aa22.48■■□□□ 1.19
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