RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 PGGT1BP53609 377 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CTC1Q2NKJ3 1217 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GAREM2Q75VX8 874 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OR6N2Q8NGY6 317 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SLAMF7Q9NQ25 335 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TRIM36Q9NQ86 728 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MARCH5Q9NX47 278 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 USP3Q9Y6I4 520 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 J3QLW9 94 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SNAPC5O75971 98 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF19P17023 458 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GADD45AP24522 165 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 LSAMPQ13449 338 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RAB11FIP2Q7L804 512 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OR52B6Q8NGF0 335 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NXPE2Q96DL1 559 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 A6NLC8 198 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 AQP9O43315 295 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OR1E2P47887 323 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 17.7
USP22-201ENST00000261497 UNC50Q53HI1 259 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 LIX1LQ8IVB5 337 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OR52P1PQ8NH57 321 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OR51A7Q8NH64 312 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SFXN2Q96NB2 322 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 C14orf119Q9NWQ9 140 aa13.13□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 H3BSH0 61 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SPARCP09486 303 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 F8A1P23610 371 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ABRAXAS2Q15018 415 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FAM189A2Q15884 450 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GPR137CQ8N3F9 429 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OSTF1Q92882 214 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CCL26Q9Y258 94 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ANXA3P12429 323 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 F3P13726 295 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HMGN2P46Q86SG4 172 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PELI2Q9HAT8 420 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 WBP1LQ9NX94 342 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PRAMEF2O60811 474 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RDH16O75452 317 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RAB36O95755 333 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NPPAP01160 153 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FCER2P06734 321 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ELK4P28324 431 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CTHP32929 405 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GPR143P51810 404 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF181Q2M3W8 571 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MUS81Q96NY9 551 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OR6C2Q9NZP2 312 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF878C9JN71 531 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GFRA2O00451 464 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PLATP00750 562 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 DNASE1P24855 282 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 HTR2BP41595 481 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RAB5BP61020 215 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RPS26P62854 115 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 IER5LQ5T953 404 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 OR52E1Q8NGJ3 308 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 FANK1Q8TC84 345 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RDH14Q9HBH5 336 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 GNG8Q9UK08 70 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MYH1P12882 1939 aa13.12□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 CLCA1A8K7I4 914 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 MSL3P1P0C860 447 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF28P17035 718 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TAS2R38P59533 333 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ZNF440Q8IYI8 595 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 ARL14Q8N4G2 192 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 NSMAFQ92636 917 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 AP1S3Q96PC3 154 aa13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
USP22-201ENST00000261497 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms