RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 SEC14L5O43304 696 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 PTGER1P34995 402 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 BLVRAP53004 296 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 MVDP53602 400 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 BTG1P62324 171 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF763Q0D2J5 394 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 C12orf73Q69YU5 71 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 AGTRAPQ6RW13 159 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 GLB1LQ6UWU2 654 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 MARVELD3Q96A59 401 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 CXorf58Q96LI9 332 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM175Q9BSA9 504 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 RNF32Q9H0A6 362 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 NLGN3Q9NZ94 848 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 FBXW2Q9UKT8 454 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 HRH3Q9Y5N1 445 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 SGK494L7N484 410 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 C1SP09871 688 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 CSKP41240 450 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 MANFP55145 182 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 ERVFC1P60507 584 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 DEFA5Q01523 94 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 TCTN3Q6NUS6 607 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 COMMD6Q7Z4G1 85 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 PLEKHH3Q7Z736 793 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 OR8D4Q8NGM9 314 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 MOSPD2Q8NHP6 518 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 GANCQ8TET4 914 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 ASB11Q8WXH4 323 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 ASB12Q8WXK4 309 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 WFDC6Q9BQY6 131 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 YIPF4Q9BSR8 244 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 BRD7Q9NPI1 651 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 IFT46Q9NQC8 304 aa12.4□□□□□ -0.42
ITGA3-201ENST00000007722 ANHXE9PGG2 379 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 ARAFP10398 606 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 CFL1P23528 166 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 PITPNBP48739 271 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 OR10A3P58181 314 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 OPCMLQ14982 345 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 LIPJQ5W064 366 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SIAH3Q8IW03 269 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 HORMAD2Q8N7B1 307 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 ASZ1Q8WWH4 475 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SLC38A2Q96QD8 506 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 KCNK12Q9HB15 430 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 CNIH4Q9P003 139 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 ATPIF1Q9UII2 106 aa12.4□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 KLKB1P03952 638 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 IL3P08700 152 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 MMP11P24347 488 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SHC1P29353 583 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SLC6A12P48065 614 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SLC3A1Q07837 685 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 ST3GAL2Q16842 350 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 RNF165Q6ZSG1 346 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 ADGRG3Q86Y34 549 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 KLHL36Q8N4N3 616 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SFXN2Q96NB2 322 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 MED18Q9BUE0 208 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 TTTY10Q9BZA0 68 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 FZD3Q9NPG1 666 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 NUMA1Q14980 2115 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 PITPNM1O00562 1244 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 GPR171O14626 319 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 NR2F1P10589 423 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 PRPH2P23942 346 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 HMGA2P52926 109 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 CNTN1Q12860 1018 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 TPBGQ13641 420 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 KCNC3Q14003 757 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 CCL14Q16627 93 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SPIN4Q56A73 249 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 TPGS1Q6ZTW0 290 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 OR51G2Q8NGK0 314 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 SLC38A5Q8WUX1 472 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 NANSQ9NR45 359 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 HLA-DQB1P01920 261 aa12.39□□□□□ -0.43
ITGA3-201ENST00000007722 URODP06132 367 aa12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms