RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf121Q8R1Z9 327 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tpra1Q99MU1 369 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GsdmcQ99NB5 468 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4933400A11RikQ9CR52 288 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prl7c1Q9CRB5 251 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Borcs5Q9D920 195 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Erv3Q9DAX3 200 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr49Q9Z1V0 313 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 IqccA2ADZ8 418 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Crisp4E9PVG4 293 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r99H3BK37 856 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Aff2O55112 1272 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdh3P10287 822 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rps4xP62702 263 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ube2iP63280 158 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf223Q3UV31 285 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pydc3Q3V3Q4 588 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TpppQ7TQD2 218 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr834Q7TRG8 312 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr667Q7TRP4 326 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 2610318N02RikQ80VT5 305 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Glrx5Q80Y14 152 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TskuQ8CBR6 354 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plcxd1Q8CHS4 345 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dnm1lQ8K1M6 742 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmem82Q8R115 356 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Atp5f1Q9CQQ7 256 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 UqcrbQ9D855 111 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plod2Q9R0B9 737 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Uba2Q9Z1F9 638 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp715G3X9T1 886 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Serpinb9cI7HJI5 387 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Emp3O35912 163 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Eif1P48024 113 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CntfP51642 198 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ErgP81270 486 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SgcdP82347 289 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rbl2Q64700 1135 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpr21Q8BX79 349 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ssxb2Q8C5Z3 165 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 EndovQ8C9A2 338 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gramd1cQ8CI52 457 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 BollQ924M5 281 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Uqcc2Q9CQY6 136 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Prl2c5Q9JLV9 222 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mid2Q9QUS6 705 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 eef1akmt3D3YWP0 232 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Chil3O35744 398 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rabl6Q5U3K5 725 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sp140Q6NSQ5 534 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Papd7Q6PB75 542 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Snrnp40Q6PE01 358 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GgnQ80WJ1 673 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bdh1Q80XN0 343 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr460Q8VF31 314 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sectm1aQ921W8 192 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Abcb9Q9JJ59 762 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Magi2Q9WVQ1 1275 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tcf20Q9EPQ8 1987 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plxna3P70208 1872 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1432A0A140LHS7 346 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AspgA0JNU3 564 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Morn1A2RTS7 477 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm5795E9PZN8 263 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm20509G3UZF1 325 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Klf6O08584 283 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 H2-EaP01904 255 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 P04224 255 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Anxa2P07356 339 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AvpP35455 168 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 StarP51557 284 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MamstrQ0ZCJ7 421 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tex52Q3TTI8 308 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Laptm5Q61168 261 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tas2r131Q7M708 310 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mapkap1Q8BKH7 522 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc25a24Q8BMD8 475 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Arfip2Q8K221 341 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Chid1Q922Q9 393 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 EsamQ925F2 394 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trem2Q99NH8 227 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rcc1lQ9CYF5 461 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ing2Q9ESK4 281 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PpieQ9QZH3 301 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sbf2E9PXF8 1872 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Samt3A2ARK7 233 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 6030498E09RikB1AX85 169 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Daw1D3Z7A5 415 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpr137cE9Q343 423 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3020E9Q3J7 150 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr1425K7N659 312 aa6.74□□□□□ -1.33
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PlgP20918 812 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.7 ms