RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617087.1

PVT1-225, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 130 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-225	ENST00000617087	CARM1	Q86X55	608 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	RMND5A	Q9H871	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087		H0YL77	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CYB561D2	O14569	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	IMPA2	O14732	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CFC1	P0CG37	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	FOSL2	P15408	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CD1D	P15813	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TSPAN8	P19075	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	OTX2	P32243	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	SRY	Q05066	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CDKN3	Q16667	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	USH1G	Q495M9	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	PARL	Q9H300	379 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	THYN1	Q9P016	225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087		H3BMH7	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	MCF2L	O15068	1137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ALOX15B	O15296	676 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TBX19	O60806	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	MBD3	O95983	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CHRNA1	P02708	482 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CLU	P10909	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ACADVL	P49748	655 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	NAPA	P54920	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	RAG2	P55895	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM50B	P56557	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ZP4	Q12836	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	EMC2	Q15006	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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