RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM64Q6YI46 380 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE3DQ7Z6J8 389 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CROCCP3Q8IVE0 287 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 OR1E3Q8WZA6 343 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 PIP5K1AQ99755 562 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC3Q9BQI4 270 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF22Q9HCT0 170 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-204ENST00000587718 LRIT2A6NDA9 550 aa23.95■■□□□ 1.43
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CAPNS1-204ENST00000587718 SNX7Q9UNH6 387 aa23.95■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS48Q7RTY5 328 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF248Q8NDW4 579 aa23.92■■□□□ 1.42
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR5AK3PQ8NH89 298 aa23.92■■□□□ 1.42
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNC2Q96PR1 638 aa23.92■■□□□ 1.42
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