RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578009.5

IFT20-205, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-205	ENST00000578009	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SNX19	Q92543	992 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	FIG4	Q92562	907 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	RGMA	Q96B86	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PYURF	Q96I23	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009		Q96MF0	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	USE1	Q9NZ43	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IFT20-205	ENST00000578009	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009		A0A1W2PRB8	838 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	PRSS38	A1L453	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009		B5MCH6	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009		H3BNH8	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	DLGAP1	O14490	977 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	TXNDC9	O14530	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	YY2	O15391	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	SLC31A1	O15431	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	TNFSF14	O43557	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	PRKD3	O94806	890 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	LRAT	O95237	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	H6PD	O95479	791 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	IFNA14	P01570	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	SEMG1	P04279	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	ALPL	P05186	524 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	ACP5	P13686	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	DDC	P20711	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	UQCRC2	P22695	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	AKT2	P31751	481 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	PCGF2	P35227	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	BSG	P35613	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	CAPG	P40121	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	CDKN2C	P42773	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	DGKE	P52429	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	ARSF	P54793	590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	NR1H2	P55055	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	TAS2R50	P59544	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IFT20-205	ENST00000578009	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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