RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDT3O95989 172 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 STSP08842 583 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CD63P08962 238 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDT17P0C025 328 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NPIPA8P0DM63 369 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CALM1P0DP23 149 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CALM2P0DP24 149 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CALM3P0DP25 149 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ITGAMP11215 1152 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FCARP24071 287 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARRB2P32121 409 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GKP32189 559 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AHRP35869 848 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTR1BP42025 376 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CRYBB2P43320 205 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR3A1P47881 315 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UQCRFS1P47985 274 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SERPINB9P50453 376 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MMP15P51511 669 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RAP1GDS1P52306 607 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NDST2P52849 883 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDT6P53370 316 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CLDN18P56856 261 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GPX6P59796 221 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HERV-K104P63124 156 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IL9RQ01113 521 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CDR2Q01850 454 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DSC1Q08554 894 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GRIK2Q13002 908 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPRRQ15256 657 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SYPL1Q16563 259 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KYAT1Q16773 422 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 Q4G0T1 1027 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C2CD6Q53TS8 623 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2A2Q6IF42 318 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF425Q6IV72 752 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ULK3Q6PHR2 472 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 VITQ6UXI7 678 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DEF8Q6ZN54 512 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PALB2Q86YC2 1186 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MFSD6LQ8IWD5 586 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CADM3Q8N126 398 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D19Q8N5T2 526 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TEX26Q8N6G2 289 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CNBD1Q8NA66 436 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GJC3Q8NFK1 279 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2L3Q8NG85 312 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ASB5Q8WWX0 329 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SMPDL3AQ92484 453 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SMARCD2Q92925 531 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LHX4Q969G2 390 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB9Q96C00 473 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM136AQ96C01 138 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB39BQ96DA2 213 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C9orf72Q96LT7 481 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SGK494Q96LW2 274 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CASD1Q96PB1 797 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TGM7Q96PF1 710 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NAT9Q9BTE0 207 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DPH7Q9BTV6 452 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM9Q9C026 710 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DPEP3Q9H4B8 488 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C12orf10Q9HB07 376 aa3.28□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms