RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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CLSTN3-212ENST00000541770 FOLH1Q04609 750 aa8.07□□□□□ -1.12
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CLSTN3-212ENST00000541770 SLC13A2Q13183 592 aa8.07□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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CLSTN3-212ENST00000541770 MYNNQ9NPC7 610 aa8.07□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.07□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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CLSTN3-212ENST00000541770 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 LIME1Q9H400 295 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 MMP25Q9NPA2 562 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.06□□□□□ -1.12
CLSTN3-212ENST00000541770 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.06□□□□□ -1.12
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