RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 PPM1AP35813 382 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 CD79BP40259 229 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PREPP48147 710 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 CASP6P55212 293 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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GPBP1-208ENST00000514387 LAPTM4AQ15012 233 aa8.39□□□□□ -1.07
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GPBP1-208ENST00000514387 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.39□□□□□ -1.07
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GPBP1-208ENST00000514387 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.39□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.39□□□□□ -1.07
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GPBP1-208ENST00000514387 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.38□□□□□ -1.07
GPBP1-208ENST00000514387 IFI44LQ53G44 452 aa8.38□□□□□ -1.07
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