RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 TSPY1Q01534 308 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 CD226Q15762 336 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 OTPQ5XKR4 325 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 LUZP1Q86V48 1076 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 C16orf74Q96GX8 76 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 SPATA17Q96L03 361 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 CXorf58Q96LI9 332 aa3.36□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 TERF2IPQ9NYB0 399 aa3.36□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 SLC17A2O00624 439 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 CYB561D2O14569 222 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 SLC2A10O95528 541 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 SAA4P35542 130 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 EPSTI1Q96J88 318 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 C19orf24Q9BVV8 132 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-221ENST00000514231 MAGEF1Q9HAY2 307 aa3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 ZNF131P52739 623 aa3.34□□□□□ -1.87
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PDE4D-221ENST00000514231 EFNA3P52797 238 aa3.32□□□□□ -1.88
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PDE4D-221ENST00000514231 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-221ENST00000514231 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-221ENST00000514231 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PDE4D-221ENST00000514231 EI24O14681 340 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-221ENST00000514231 SH2D1BO14796 132 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-221ENST00000514231 ALPIP09923 528 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-221ENST00000514231 VCLP18206 1134 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-221ENST00000514231 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
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